การเลือกใช้หมึกพิมพ์เฟล็กโซกราฟีควรสอดคล้องกับปัจจัยต่างๆ สิ่งที่สำคัญที่สุดในการเลือกใช้เรซิ่นสำหรับหมึกพิมพ์เฟล็กโซกราฟี คือ การเลือกเรซิ่นที่มีสมบัติการละลายในตัวทำละลายที่ไม่มีผลต่อการทำลายแม่พิมพ์ยาง โดยปกติแล้วแม่พิมพ์ยางในระบบการพิมพ์ในระบบการพิมพ์เฟล็กโซกราฟี 2 ประเภท คือ แม่พิมพ์ยางธรรมชาติและแม่พิมพ์ยางสังเคราะห์ แม่พิมพ์ยางทั้ง 2 ประเภท มีสมบัติต้านทานต่อตัวทำละลาย แตกต่างกัน แต่โดยรวมแม่พิมพ์ทั้ง2 ประเภท ไม่ทนต่อตัวทำละลายประเภทอะโรมาติก ซึ่งเป็นตัวทำละลายที่มีหมู่วงแหวนเบนซินอยู่ในโครงสร้างทางเคมี ตัวทำละลายประเภทนี้ เช่น ด?ลูอีน ตัวทำละลายที่ใช้กับหมึกพิมพ์เฟล็กโซกราฟีควรเป็นตัวทำละลายประเภทแอลกอฮอล์ และเอสเทอร์ เท่านั้น
ในการเลือกเรซิ่่นสำหรับหมึกพิมพ์เฟล็กโซกราฟีนั้น สิ่งที่ต้องคำนึงถึงคือ เรซิ่นต้องละลายในตัวทำลายประเภทที่กล่าวมาแล้ว ให้สมบัติกับการยึดติดกับวัสดุพิมพ์ มีสมบัติการเปียกกับผงสีได้ เป็นเรซิ่นที่มีการสร้างชั้นฟิล์มอย่างรวดเร็ว มีกลิ่นน้อย ให้ค่าตกค้างของตัวทำละลายต่ำ และควรมีสมบัติเข้ากันได้ดีกันเรซิ่นร่วมชนิดอื่นๆ โดยทั่วไปเรซิ่นแต่ละชนิดจะให้สมบัติตามปัจจัยที่ระบุมาไม่ครบถ้วน จึงทำให้มีการใช้เรซิ่นหลายชนิดในการผลิตหมึกพิมพ์ชนิดหนึ่ง ทั้งนี้ก็ขึ้นอยู่กับวัสดุที่ใช้พิมพ์ด้วย การใช้เรซิ่นหลายๆชนิดในหมึกพิมพ์ชนิดหนึ่งๆ อาจก่อให้เกิดปัญหาการไม่รวมตัวกันหรือเข้ากันไม่ได้ระหว่างเรซิ่นแต่ละชนิด นอกจากนี้การเลือกใช้ตัวทำละลายที่ไม่เหมาะสมก็จะมีผลต่อสมบัติของหมึกพิมพ์ด้วย ดังนัน้ควรคำนึงถึงทั้งการเข้ากันได้ของเรซิ่นที่ใช้ กับการเลือกใช้ตัวทำละลายที่เหมาะสมในการผลิตหมึกพิมพ์
ในการเลือกเรซิ่่นสำหรับหมึกพิมพ์เฟล็กโซกราฟีนั้น สิ่งที่ต้องคำนึงถึงคือ เรซิ่นต้องละลายในตัวทำลายประเภทที่กล่าวมาแล้ว ให้สมบัติกับการยึดติดกับวัสดุพิมพ์ มีสมบัติการเปียกกับผงสีได้ เป็นเรซิ่นที่มีการสร้างชั้นฟิล์มอย่างรวดเร็ว มีกลิ่นน้อย ให้ค่าตกค้างของตัวทำละลายต่ำ และควรมีสมบัติเข้ากันได้ดีกันเรซิ่นร่วมชนิดอื่นๆ โดยทั่วไปเรซิ่นแต่ละชนิดจะให้สมบัติตามปัจจัยที่ระบุมาไม่ครบถ้วน จึงทำให้มีการใช้เรซิ่นหลายชนิดในการผลิตหมึกพิมพ์ชนิดหนึ่ง ทั้งนี้ก็ขึ้นอยู่กับวัสดุที่ใช้พิมพ์ด้วย การใช้เรซิ่นหลายๆชนิดในหมึกพิมพ์ชนิดหนึ่งๆ อาจก่อให้เกิดปัญหาการไม่รวมตัวกันหรือเข้ากันไม่ได้ระหว่างเรซิ่นแต่ละชนิด นอกจากนี้การเลือกใช้ตัวทำละลายที่ไม่เหมาะสมก็จะมีผลต่อสมบัติของหมึกพิมพ์ด้วย ดังนัน้ควรคำนึงถึงทั้งการเข้ากันได้ของเรซิ่นที่ใช้ กับการเลือกใช้ตัวทำละลายที่เหมาะสมในการผลิตหมึกพิมพ์